800K芯片
产品简介
小麦800K超高密度芯片由河南农业大学陈锋团队联合成都天成未来科技有限公司共同开发完成。基于小麦泛基因组使用全球范围内的小麦材料进行分析,选择代表性的多态性位点,主要覆盖基因及调控区域变异信息。该芯片是目前公开报道的密度最高的液相捕获探针产品之一,可满足小麦群体研究的各类需求。
产品特点
WheatPan800K芯片的位点来源世界范围内近3000份自然群体。涵盖了国内主要的现代品种、历史品种、地方品种及人工合成小麦。同时收集了来自欧洲、非洲、美洲主要小麦栽培品种及育种材料,是目前涵盖群体遗传信息最多的小麦SNP芯片之一。
在实际应用中,500份自然群体检测,使用GWAS过滤标准过滤后获得了总计2.9M(2,908,429)的高质量SNP/InDel位点变异信息,远超于目前所有小麦芯片检测结果。仅次于重测序能够检测到的变异信息,但检测成本与分析成本都远低于重测序方案。
表1 500份材料检测结果染色体统计
产品应用
01 全基因组关联分析
02 全基因组选择育种
03 遗传多样性分析
04 种质资源精准鉴定
05 分子标记辅助选择
06 遗传图谱构建
07 QTL定位分析
08 BSA定位分析